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简答题当抑制剂能选择性地和不可逆地与酶的活性部位的残基结合，从而能帮助鉴别酶时，这类抑制剂就可以称为亲和标记试剂。已知TPCK是胰凝乳蛋白酶的亲和标记试剂，它通过使蛋白质His烷基化而使其失活。为胰蛋白酶设计一个类似TPCK的亲和标记试剂还可以用于什么蛋白质？
  • 首先分析TPCK作为胰凝乳蛋白酶的亲和标记试剂具有什么特征结构。一般来说，亲和标记试剂有两个特点：
    ①亲和标记试剂与底物非常类似，但缺乏可以被酶作用的位点，因而能选择性地与酶的活性部位结合，却不被酶作用，TPCK的结构中这一部分是其对甲苯磺酰-苯丙氨甲基酮部分；
    ②亲和标记试剂有活泼的化学基团，可以与靶酶的活性部位中的某个残基反应，形成稳定的共价键。TPCK的反应基团是-CH2-Cl。
    其次分析胰蛋白酶与胰凝乳蛋白酶有什么相似之处。已知胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶均催化肽键的裂解反应，其结构和作用机制很相似，它们的活性部位都位于酶分子表面凹陷的口袋中，都有由His、Asp和Ser形成的催化三联体，只是专一性明显不同。胰凝乳蛋白酶的口袋被疏水氨基酸环绕，大到足以容纳一个芳香残基，因此该酶选择裂解芳香氨基酸如Phe和Tyr的羧基侧肽键。而胰蛋白酶口袋的底部有一个带负电荷的Asp189，有利于结合带正电荷Arg和Lys残基。
    根据上述分析可知：
    （1）为胰蛋白酶设计一个类似TPCK的亲和标记试剂，可以将TPCK的反应基团—CH2—Cl和类似肽键结构—NH—CH—CO—保留，其余部分更换为带正电荷的Arg或Lys的R基团或其类似物；
    （2）检验该抑制剂的专一性实际上就是分析其与酶的竞争结合能力，可以设计动力学实验，即分析在没有抑制剂时和有不同浓度抑制剂存在时反应速度随底物浓度的变化；
    （3）由于弹性蛋白与上述两种酶空间结构和催化机理相似，推测该亲和标记试剂有可能使弹性蛋白酶失活。

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