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- 简答题计算机辅助药物设计中,对于受体的三维结构尚未发现的情况下,常用的三维研究方法有哪些,简述其概况。
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(1)分子形状分析法(MSA)。其理论基础是认为药物分子有多种构象,每种构象可视为一种形状,药物活性与这些形状对受体的活性部位(空穴)的适应能力有关。该方法的操作过程是,先计算各药物分子的优势构象,一般以活性最强者为模板,其他分子与其合理叠合,求出分子形状参数,进行QSAR计算,分析受体活性部位形状,并根据这些参数设计新的化合物。
(2)距离几何学方法 (DG),药物与受体的相互作用是通过药物的活性基团与受体受点直接作用产生,其活性强弱与药物和受点的结合能大小有关,通过选择合理的受体结合点分布模型,建立药物活性基团和受体结合点类型相关的能量参数。
(3)比较分子场分析法(CoMFA ),采用化合物周围的静电场、范德华力场、氢键场的空间分布作为化合物结构特征变量,用数学方法建立化合物的生物活性与化合物周围上述各力场空间分布之间关系的模型。用分子力场模型描述受体与配体结合的理化环境,设计新药并预测活性。简单来说,就是用分子场研究药物与受体间的相互作用。 关注下方微信公众号,在线模考后查看
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