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简答题分析影响限制性内切酶酶切的因素有哪些?
  • (1)温度:大部分限制性内切酶最适反应温度为37℃,少数酶高于或低于这个温度。
    (2)时间:合适,大多为1h,可过夜反应。
    (3)溶液体系:要求有稳定的pH环境。标准的缓冲溶液中含有氯化钙、氯化镁或氯化钾、Tris-HCl、β-巯基乙醇或二硫苏糖醇(DTT)以及牛血清蛋白质(BSA)和Mg2+,具有一定的酸碱值即pH值。
    (4)盐离子浓度:不同的限制性内切酶对盐离子强度(Na+)有不同的要求,一般按离子强度不同分为低(0mmol/L)、中(50mmol/L)、高盐(100mmol/L)三类。Mg2+也是限制性内切酶酶切反应所需。
    (5)反应体积和甘油浓度:在进行酶切反应时,加酶的体积一般不超过总反应的10%,若加酶体积太大,甘油浓度过高,则会影响酶切反应。
    (6)DNA的纯度和结构:DNA样品中所含的蛋白质、有机溶剂及RNA等杂质均会影响酶切反应速度和酶切的完全度,酶切的底物一般是双链DNA,DNA的甲基化位置会影响酶切反应。
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