试题详情
- 简答题比较两种DNA快速测序的方法,包括方法的原理和优缺点。
- 目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的双脱氧法(酶法)及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱基出现在可变终止端的机会均等,因些上述每一组产物都是一些寡核苷酸混合物,这些寡核苷酸的长度由某一种特定碱基在原DNA全片段上的位置所决定。然后在可以区分长度仅差一个核苷酸的不同DNA分子的条件下,对各组寡核苷酸进行电泳分析,只要把几组寡核苷酸加样于测序凝胶中若干个相邻的泳道这上,即可从凝胶的放射自影片上直接读出DNA上的核苷酸顺序。 Sanger法DNA测序Sanger 法测序的原理就是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止。终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。
S.anger 法测序快速、省事,不需要比强很高的32P-dNTP,但有时会出现一些不够清晰的结果。
M.axam-Gilbert DNA化学降解法
化学降解法的原理是首先标记双链DNA的5’端,然后加入二甲基亚砜并加热到90°C,使双链DNA分子变成单链。通过凝胶电泳分离两条链,其中一条链含有更多的嘌呤成为重链,另一条链为轻链。纯化两条链,分成四份,分别利用不同的降解试剂进行降解(哌啶,氮杂环己烷),产生了一系列的降解片段。可以通过电泳分离显示出来。
化学降解法可以提供比较清晰的结果,但步骤繁琐,许多药品有剧毒。 关注下方微信公众号,在线模考后查看
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