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简答题简述几种DNA测序的方法,比较优缺点。
  • 1.Sanger双脱氧连终止法;2.Maxam-Gilbert化学降解法;3.DNA自动测序化。
    Maxam-Gilbert法所能测定的长度要比Sanger法短一些,它对放射性标记末端250个核苷酸以内的DNA序列效果最佳。Sanger法需要单链模板和特异寡核苷酸,并需获得大肠杆菌DNA聚合酶IKlenow片段的高质量酶制剂,而Maxam-Gilbert法只需简单化学试剂。随着M13噬菌体和噬菌粒载体的发展,也由于现成的合成引物唾手可得及测序反应日臻完善,双脱氧链终止法如今远比Maxam-Gilbert法应用得广泛。化学降解较之链终止法具有一个明显的优点:所测序列来自原DNA分子而不是酶促合成所产生的拷贝。因此,利用Maxam-Gilbert法可对合成的寡核苷酸进行测序,可以分析诸如甲基化等DNA修饰的情况。由于Sanger法既简便又快速,因此是现今的最佳选择方案。事实上,目前大多数测序策略都是为Sanger法而设计的。
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