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- 简答题docking步骤是什么？
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受体模型的建立；小分子库的产生；计算机筛选和命中化合物的后处理。
第一步，受体模型的建立：
1.大分子结构获取：蛋白质结构的准备是虚拟筛选的重要一步。虚拟筛选的蛋白靶标的结构可以从PDB库（http：//www.rcsb.org/pdb/index.html）中直接下载使用；也可以通过和家族中同源蛋白的序列、结构信息比较，同源模建而得。
2.接着是结合位点的描述，选择合适的配体结合口袋对分子对接至关重要。
第二步，建立小分子数据库：二维结构用结构转换程序如CORINA、CONCORD实现三维结构的转化。建好的三维结构加氢加电荷后，便可以用于对接程序。（剑桥小分子数据库，MDL数据库，天然产物数据库）
第三步，对接和打分，这一步是虚拟筛选的核心步骤。对接操作就是把每个小分子放到受体蛋白的配体结合位点，优化配体构像和位置，使之与受体有最佳的结合作用，给最佳结合构象打分，对所有化合物根据打分排序，然后从化合物库中挑出打分最高的小分子。
最后一步是命中化合物的后处理：通过计算分子的类药性质ADME/T（吸收absorption、器官分布distribution、体内代谢metabolism、排泄excretion和毒性toxicity）性质的估算，排除那些不具有类药性质的分子。可以利用一些经验规则如“五规则”等，快速排除那些不适合进一步药物开发的分子。
通过以上四步处理，大部分分子从化合物库中剔除，形成一个合理大小的化合物库，仅对这些适合成药的化合物或购买、或合成、或分离得到，然后再进行实际的生物测试。 关注下方微信公众号，在线模考后查看
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