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简答题何谓Long Interspersed NuclearElements,你认为该序列的进化起源是什么?
  • 长散在重复序列(long interspersed nuclear elements,LINE),意为散在分布的长细胞核因子,是散在分布在哺乳动物基因中的一类重复序列。LINE是可以自主转座的一类反转录转座子,来源于RNA聚合酶Ⅱ的转录产物;L1是LINE中的一种重复序列,长约6 500bp,哺乳动物基因组中的拷贝数可多达10万份,主要集中在AT富集区。L1以及由L1编码的反转录酶作用于其他非自主反转录转座子以后所生成的DNA序列,加起来至少占人类基因组全长的四分之一。LINE不同成员之间的序 ,列有较大差别,但是同一物种中的LINE的不同成员仍有较大的同源性。LINE有分别长1 137bp和3 900bp的可读框,这两种可读框有14bp的重叠序列。从LINE的结构分析,它并不具有反转录病毒特有的LTR,因此曾把LINE归于非病毒超家族。测序的结果发现LINE L1的一个可读框同反转录酶是同源的,这提示LINE可能来源于能够编码转座所需的酶进行自主转座的可动元件,所以现在在分类时被归人病毒超家族。L1插入片段的全长原初元件可能是哺乳动物中有活性的反转录转座子的来源。L1被认为是人类基因组中主要的可动因子,它不仅能自主转座 ,而且它的蛋白质产物可促使非自主转座因子的反转录转座。同时L1还能十分有效地将位于L1 3’端的侧序一起转座到新的位置,这种作用称为3"转导(3"transduction),其结果是将宿主基因组中原先不连锁的两个DNA片段排列在一起。许多真核细胞中都发生3"转导作用。当L1本身的转录终止信号较弱而3"侧序中有很强的转录终止信号时,RNA聚合酶进行L1转录时就会发生“连读” (read-through),而将11’和 3"侧序一起转录,其结果是包含L1和3"侧序的嵌合片段一起插入染色体新的位置,这对新基因的形成和基因组的进化都有重要作用.
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