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简答题小批量碱变性提取质粒DNA的原理与基本过程如何?
  • 碱变性法是常用的质粒抽提方法,其原理是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离目的。在pH值高达12.6的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开而变性。质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会完全分离,当以pH4.8的NaAc高盐缓冲液去调节其pH值至中性时,变性的质粒DNA又恢复原来的构型,保存在溶液中,而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
    小批量碱变性提取质粒DNA的基本过程为——
    (1)酶或机械法等方法破坏细胞,释放出胞内物质;
    (2)加碱使DNA与蛋白质变性,加中和液复性。因为质粒DNA分子量小易复性,从而使得其与基因组DNA分离;
    (3)在上清液中通过酚-氯仿抽提、去垢剂或酶使剩余蛋白质变性或水解,除去蛋白质;
    (4)再加入醇溶液使质粒DNA变性沉淀而与其他水溶性物质分离;
    (5)将沉淀溶解于有RNase的TE溶液中,温育降解RNA后电泳检测、-20℃保存。
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