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- 简答题合成cDNA第二条链有哪些方法?
- 合成cDNA第二条链有两种方法。一种方法是利用cDNA第一链的3’末端常常出现发夹环的特征,这种发夹结构是反转录酶在第一链末端“返折”并且进行复制第一链的结果,它为合成cDNA第二链提供了有用的引物。用这种方法合成的双链cDNA在一端有一个发夹环,可以用单链特异的S1核酸酶切去。但是S1核酸酶的处理,常常会“修剪”过多的cDNA顺序,使cDNA丢失了mRNA5’端的部分顺序。另一种方法是用大肠杆菌的RNaseH进行修饰。RNaseH能识别RNA-DNA杂交分子并把其中的RNA切割成短的片段,这些RNA短片段仍与cDNA第一链结合,可被新合成的DNA所取代。新合成的DNA存在切口,用DNA连接酶把这些切口连接在一起形成一条完整的DNA链。RNaseH法优于S1核酸酶法,它能获得包括mRNA5’端全部或绝大部分的更长顺序cDNA分子。
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